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言路

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微隐于学

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发布: 7:30am 31/12/2020

宋明家.我寻,故病毒在

作者: 宋明家(科學工作者)

对新冠病毒这种RNA病毒类来说,“变种”这码事,就如人类吃饭睡觉般平常。

在高倍数显微镜下,新冠病毒的基因组,就如一条由约2万9千个、四种A、U、C或G的“字母”(科学名称为“核苷酸”)串成的长链。基因组学家可以在这长长的字母链上,找到11个长短不一的“基因”片段;这些基因,是病毒用来执行制造蛋白质和繁衍后代的任务。

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说白点,长链若是一本食谱集,一个基因就是其中一页的菜肴食谱;基因(食谱)上的字母(食材)若更改了,制造出来的蛋白质(菜肴)就不一样,甚至无法制造该蛋白质。

但病毒在拷贝复制的繁衍过程中,时常会发生小差错,比如长链上原本应该是C字母的,不小心被换成其他字母(或称“突变”mutation),要不就是没有被拷贝到;根据统计,新冠病毒的突变率大概是每个月有1至2个字母被替换。

如果这种小差错发生在一些重要基因,比如一个被称为“刺突S蛋白”(spike protein)的基因,那病毒执行“攻击人体细胞”任务的效率就会被改变。

那个9月份在英国发现的B.1.1.7新变种,就是因为S基因的17个字母改变了,造成它的传播力比一般病毒快56%(之前的粗略估计是70%)(引英国London School of Hygiene & Tropical Medicine科研团队于12月23日上载的未经同侪评审的预印本论文)。这新变种很不寻常的一次过出现那么多突变,使科学家极之担忧;目前的猜测,是这病毒起先依附在某个病患比较长的时间,让它有机会经历更多演化历程,致使更多不同字母被替换,最后形成新变种。到11月中旬,这变种占了英国病例的26%;来到12月中,这比例已经提高至三分之一。

更糟糕的是,南非也发现了相关新变种病例,而且该国病例也在迅速增加。

从9月份开始至今,这三个多月期间从欧洲入境世界各国的人,肯定已经把病毒散播到全世界。

这不是危言耸听。随着新加坡在12月24日发现首宗新变种病例,韩国、加拿大、日本和一些欧洲国家也相续传出该新变种的病例。

目前我国还没有B.1.1.7新变种病例的报告,但“没有发现”,并不代表“不存在”;想要知道国内有没有该变种案例,就必须为从确诊患者采集的病毒RNA进行基因组测序(genome sequencing),亦即使用生物科技方法,找出病毒那条“长链”上的近三万个字母。

也就是说,一个国家能不能及时发现病毒新变种,是依赖该国“已测序的基因组”在“确诊病例总数”中的百分比。

依据新冠病毒的全基因组GISAID数据库(Global Initiative on Sharing All Influenza Data),截至12月29日晚上11点,我国有295个新冠病毒基因组被测序,而国内目前确诊总数达108615例,这“基因组测序百分比”就是0.27%(295/108615)。

英国、日本、新加坡、韩国、加拿大这些已经发现B.1.1.7新变种的国家,基因组测序百分比都比我国高,分别是6.01%(140073 /2329730),4.38%(9650/220236)、2.64%(1543/58542)、1.45%(851/58725)、0.71%(3921/555207)。

由于每一个新冠病毒的基因组测序费大约是1200令吉(大量测序的话价格较低),我国政府在新冠病毒测序不够落力,很可能是因为昂贵的基因组测序费用。

但卫生部为对抗疫情而获得的拨款也不少,单单就2020年,就有10亿令吉被拨于医药抗疫用途,2021年也获得4亿7千500万令吉,用于购买试剂和实验室各种用品。这些拨款如有一微小部分,比如200万令吉拨给研究机构,用来进行基因组测序,马来西亚的基因组测序率就能被提高至2%,也更有可能及时发现新变种病例。

令人汗颜的是,马来西亚的新冠病毒基因组测序率,一直都低于全球的0.37%平均率(302,038/81,819,305);就连泰国和越南这两个比我们穷的东南亚邻居,也在使用基因组检测监督疫情这方面,比我国好得多:泰国9.18%( 591/6440)、越南7.84%(114/1454)。

若基因组测序率低,表示我们及时找到变种病毒案例的几率也低;这不但影响政府监测国内各种变种病毒的出现和传播,在提供充足的医疗系统和前线人员这些事上,更无法妥善做到未雨绸缪的安排工作。

随着确诊病例逐日增加,政府必须做的,是主动出击,加强基因组测序的力度,从而有效的监测病毒传播。

而不是被动的坐着,等着被病毒牵制每一个抗疫步伐。

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