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言路

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微隐于学

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发布: 7:30am 31/12/2020

宋明家.我尋,故病毒在

作者: 宋明家(科學工作者)

對新冠病毒這種RNA病毒類來說,“變種”這碼事,就如人類吃飯睡覺般平常。

在高倍數顯微鏡下,新冠病毒的基因組,就如一條由約2萬9千個、四種A、U、C或G的“字母”(科學名稱為“核苷酸”)串成的長鏈。基因組學家可以在這長長的字母鏈上,找到11個長短不一的“基因”片段;這些基因,是病毒用來執行製造蛋白質和繁衍後代的任務。

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說白點,長鏈若是一本食譜集,一個基因就是其中一頁的菜餚食譜;基因(食譜)上的字母(食材)若更改了,製造出來的蛋白質(菜餚)就不一樣,甚至無法制造該蛋白質。

但病毒在拷貝複製的繁衍過程中,時常會發生小差錯,比如長鏈上原本應該是C字母的,不小心被換成其他字母(或稱“突變”mutation),要不就是沒有被拷貝到;根據統計,新冠病毒的突變率大概是每個月有1至2個字母被替換。

如果這種小差錯發生在一些重要基因,比如一個被稱為“刺突S蛋白”(spike protein)的基因,那病毒執行“攻擊人體細胞”任務的效率就會被改變。

那個9月份在英國發現的B.1.1.7新變種,就是因為S基因的17個字母改變了,造成它的傳播力比一般病毒快56%(之前的粗略估計是70%)(引英國London School of Hygiene & Tropical Medicine科研團隊於12月23日上載的未經同儕評審的預印本論文)。這新變種很不尋常的一次過出現那麼多突變,使科學家極之擔憂;目前的猜測,是這病毒起先依附在某個病患比較長的時間,讓它有機會經歷更多演化歷程,致使更多不同字母被替換,最後形成新變種。到11月中旬,這變種佔了英國病例的26%;來到12月中,這比例已經提高至三分之一。

更糟糕的是,南非也發現了相關新變種病例,而且該國病例也在迅速增加。

從9月份開始至今,這三個多月期間從歐洲入境世界各國的人,肯定已經把病毒散播到全世界。

這不是危言聳聽。隨著新加坡在12月24日發現首宗新變種病例,韓國、加拿大、日本和一些歐洲國家也相續傳出該新變種的病例。

目前我國還沒有B.1.1.7新變種病例的報告,但“沒有發現”,並不代表“不存在”;想要知道國內有沒有該變種案例,就必須為從確診患者採集的病毒RNA進行基因組測序(genome sequencing),亦即使用生物科技方法,找出病毒那條“長鏈”上的近三萬個字母。

也就是說,一個國家能不能及時發現病毒新變種,是依賴該國“已測序的基因組”在“確診病例總數”中的百分比。

依據新冠病毒的全基因組GISAID數據庫(Global Initiative on Sharing All Influenza Data),截至12月29日晚上11點,我國有295個新冠病毒基因組被測序,而國內目前確診總數達108615例,這“基因組測序百分比”就是0.27%(295/108615)。

英國、日本、新加坡、韓國、加拿大這些已經發現B.1.1.7新變種的國家,基因組測序百分比都比我國高,分別是6.01%(140073 /2329730),4.38%(9650/220236)、2.64%(1543/58542)、1.45%(851/58725)、0.71%(3921/555207)。

由於每一個新冠病毒的基因組測序費大約是1200令吉(大量測序的話價格較低),我國政府在新冠病毒測序不夠落力,很可能是因為昂貴的基因組測序費用。

但衛生部為對抗疫情而獲得的撥款也不少,單單就2020年,就有10億令吉被撥於醫藥抗疫用途,2021年也獲得4億7千500萬令吉,用於購買試劑和實驗室各種用品。這些撥款如有一微小部分,比如200萬令吉撥給研究機構,用來進行基因組測序,馬來西亞的基因組測序率就能被提高至2%,也更有可能及時發現新變種病例。

令人汗顏的是,馬來西亞的新冠病毒基因組測序率,一直都低於全球的0.37%平均率(302,038/81,819,305);就連泰國和越南這兩個比我們窮的東南亞鄰居,也在使用基因組檢測監督疫情這方面,比我國好得多:泰國9.18%( 591/6440)、越南7.84%(114/1454)。

若基因組測序率低,表示我們及時找到變種病毒案例的幾率也低;這不但影響政府監測國內各種變種病毒的出現和傳播,在提供充足的醫療系統和前線人員這些事上,更無法妥善做到未雨綢繆的安排工作。

隨著確診病例逐日增加,政府必須做的,是主動出擊,加強基因組測序的力度,從而有效的監測病毒傳播。

而不是被動的坐著,等著被病毒牽制每一個抗疫步伐。

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