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微隐于学

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发布: 7:50am 03/03/2022

delta

宋明家

快筛试剂盒

omicron

微隱於學

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宋明家

快筛试剂盒

omicron

微隱於學

宋明家.Omicron變種導致抗原快篩不準確?

宋明家

科學家需要更多詳細研究(更多樣本、更完善的實驗設計),去證實“Omicron變異株導致抗原快篩不準確”的論點。

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最近因“快篩試劑盒敏感性低”的議題,衍生出“快篩結果呈偽陰性,罪魁禍首是Omicron”的另一個問題。眾說紛紜,莫衷一是。我們可以回到科學研究,嘗試去了解真相。

這個2021年11月在南非被發現的Omicron變異株,其傳播率高的原因,主要源於它S刺突蛋白(spike protein)的大量變異(至少有30個氨基酸替換substitutions、三個缺失deletions、一個插入insertion)。

除了S基因突變,負責生產病毒“核殼蛋白”(nucleocapsid protein)的基因也存在至少四個變異點(三個替換R203K、G204R、P13L、一個缺失Del31-33);由於該蛋白被用來設計幾乎所有抗原快篩試劑盒附在纖維素膜(nitrocellulose membrane,試劑盒上的白色“紙條”)的抗體,因此Omicron這四個變異點一開始就被科學家預測會帶來“抗原快篩不準確”的後果。

到目前為止,以試劑盒檢測Omicron的研究只有寥寥數個,以下焦聚五個最新研究發現:

(1)英國UK Health Security Agency(舊稱Public Health England)在2021年12月17日的例常報告提到,以五種不同抗原試劑盒測試Omicron變異株和病毒原生型(wild type),發現這些試劑盒沒有因Omicron的氨基酸變異而降低它們的敏感性,還是一樣能偵測到Omicron。

(2)美國Brigham and Women’s Hospital團隊針對Omicron和Delta確診者各兩位的鼻腔拭子樣品,用一款BinaxNow快篩抗原試劑盒,測試對這兩種變異株的敏感性。結論是:BinaxNow快篩抗原試劑盒可以測得到Omicron毒株。(引12月27日medRxiv預印本論文。)

(3)美國COVID-19 Sports and Society Working Group研究人員的報告顯示,“鼻腔拭子”抗原試劑盒比RT-PCR測試遲2天測得Omicron病毒。也就是說在頭兩天,當RT-PCR已偵測到病毒時,抗原快篩還是呈“為陰性”結果。(引1月5日medRxiv預印本論文。)

(4)美國Harvard Medical School團隊使用BinaxNow快篩試劑盒測試32個Omicron樣本和30個Delta樣本,發現檢測敏感性降低。(引1月11日medRxiv預印本論文。)

(5)瑞典University of Geneva科學團隊使用8種快篩抗原試劑盒,然後檢測培養皿的不同變異毒株,包括Omicron、Alpha、Beta、Gamma和Delta variants。研究成果引起科學界的廣泛討論:除了其中Wondfo和Flowflex試劑盒(對Omicron的敏感性稍微比Delta毒株高一點),其餘六種試劑盒對Omicron敏感性都比其他毒株低。(引2022年1月17日medRxiv預印本論文。)

由於該研究只使用培養病毒(而不是病人身上病毒),這些數據起先被科學界質疑它的可靠性;研究團隊隨後發佈跟進實驗,採用18和17個分別來自Omicron和Delta確診病人的樣品,以測試7款快篩抗原試劑盒的敏感性;其中有四款顯示“對Omicron較低敏感性”,其餘三個則是“敏感性相當”;而整體“真陽性”(true positive)而言,Omicron和Delta的數據分別是49%和66%。

以目前這些研究數據來看,我們可以做出以下推論:

一、統計這些研究數據(使用某些特定試劑盒),快篩抗原檢測對Delta變種的整體敏感性約80%,對Omicron的整體敏感性則為37%。

二、Omicron的nucleocapsid蛋白上的四個氨基酸變異,很可能已降低某些抗原試劑盒對該毒株的敏感性,幾乎證實了早前科學家“Omicron使抗原快篩不準”的預測。

三、某些抗原試劑盒可能因為產品設計(比如抗體濃度比較高,以及其他未知原因)的關係,使它們有能力偵測到Omicron毒株。

無論如何,由於這些研究都還未通過同儕審核,它們的數據也有可能不會被學術期刊接受,況且這些數據也不夠充足,因此全世界絕大多數試劑盒廠家,都不敢貿然針對這議題發表聲明。比如澳洲批准使用的23個居家抗原試劑盒當中,只有一家宣稱他們的產品能檢測得到Omicron(雖然該國Therapeutic Goods Administration還未證實此聲明)。(見1月27日《The Guardian》報道。)

簡言之,科學家需要更多詳細研究(更多樣本、更完善的實驗設計),去證實“Omicron變異株導致抗原快篩不準確”的論點。

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